{"id":56267,"date":"2020-06-12T10:04:25","date_gmt":"2020-06-12T08:04:25","guid":{"rendered":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/?p=56267"},"modified":"2020-12-02T12:01:37","modified_gmt":"2020-12-02T11:01:37","slug":"radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/","title":{"rendered":"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Autor principal: Luis Eduardo Manotas S.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Vol. XV; n\u00ba 11; 469<!--more--><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Radiology of the genomic structure of coronavirus SARS-CoV-2<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Fecha de recepci\u00f3n: 17\/05\/2020<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Fecha de aceptaci\u00f3n: 08\/06\/2020<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Incluido en Revista Electr\u00f3nica de PortalesMedicos.com Volumen XV. N\u00famero 11 \u2013\u00a0 Primera quincena de Junio de 2020 &#8211; P\u00e1gina inicial: Vol. XV; n\u00ba 11; 469<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>AUTORES:<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Luis Eduardo Manotas S., M.D, PhD. Investigador, Director Cient\u00edfico: IPS Centro M\u00e9dico San Gregorio Hern\u00e1ndez, In\u00edrida (Guain\u00eda), Colombia.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">01\/05\/2020.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Resumen.<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Se realiz\u00f3 una revisi\u00f3n de genomas publicados del coronavirus 2 del s\u00edndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2), en la base de datos de libre acceso registrados por la Global Initiative on Sharing All Influenza Database (GISAID; https:\/\/www.gisaid.org\/), a trav\u00e9s del an\u00e1lisis de las secuencias gen\u00f3micas publicadas del SARS-CoV-2, en total al momento de la b\u00fasqueda se encontraban compartidas 15066. La secuencia inicialmente publicada del \u00a0SARS-CoV-2 se compar\u00f3 con los genomas existentes utilizando el programa inform\u00e1tico de alineamiento de secuencias de ADN, ARN y prote\u00ednas: NCBI\/BLAST (National Center for Biotechnology Information\/Basic Local Alignment Search Tool), \u00a0(https:\/\/blast.ncbi.nlm.nih.gov\/Blast.cgi), programa que es de dominio p\u00fablico y disponible para ser instalado. Adem\u00e1s se consultaron varias fuentes documentales utilizando los descriptores: escritura cient\u00edfica, revisiones, videos y mapas conceptuales; los registros obtenidos de los descriptores para el SARS-CoV-2 oscilaron entre 141 genomas y 1200 de los genes, tras la combinaci\u00f3n de las diferentes palabras clave. Tambi\u00e9n se realizo\u0301 b\u00fasqueda en internet en el \u201cgoogle acad\u00e9mico\u201d con los mismos t\u00e9rminos. Tras seleccionar un n\u00famero determinado de art\u00edculos, se agruparon por el sentido de sus resultados y se discutieron a la luz de las caracter\u00edsticas metodol\u00f3gicas de cada estudio, para derivar una conclusi\u00f3n general.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Palabras clave<\/strong>:\u00a0SARS-CoV-2, COVID-19, genoma, variantes fenot\u00edpicas, evoluci\u00f3n, mutaciones, intercambio de genes e implicaciones biol\u00f3gicas.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Summary.<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">A published genome review of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) was conducted in the open access database recorded by the Global Initiative on Sharing All Influenza Database (GISAID; https:\/\/www.gisaid.org), through analysis of the published genomic sequences of SARS-CoV-2, in total at the time of search were shared 15951. The initially published SARS-CoV-2 sequence was compared to existing genomes using the DNA, RNA and protein sequence alignment software: NCBI\/BLAST (National Center for Biotechnology Information\/Basic Local Alignment Search Tool), (https:\/\/blast.ncbi.nlm.nih.gov\/Blast.cgi), a program that is public domain and available for installation. In addition, several documentary sources were consulted using the descriptors: scientific writing, revisions, videos and conceptual maps; the records obtained from the descriptors for SARS-CoV-2 ranged from 141 genomes to 1200 of genes, following the combination of the different keywords. an internet search was also performed on the \u00abacademic google\u00bb with the same terms. After selecting a certain number of articles, they were grouped by the meaning of their results and discussed in the light of the methodological characteristics of each study, to derive a general conclusion.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Keywords: <\/strong>SARS-CoV-2, COVID-19, genome, phenotypic variants, evolution, mutations, gene exchange and biological implications.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Introducci\u00f3n.<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Los coronavirus son causa de infecciones respiratorias, ent\u00e9ricas y sist\u00e9micas graves, con un espectro amplio de hu\u00e9spedes, incluyendo el hombre, mam\u00edferos, peces y el aviar; el inter\u00e9s cient\u00edfico de estos virus aument\u00f3 despu\u00e9s de la aparici\u00f3n de los brotes respiratorios por los coronavirus SARS-CoV (Severe Acute Respiratory Syndrome\u2013Coronavirus) en 2002-2003 seguidos del MERS-CoV (Middle East Respiratory Syndrome-Coronavirus)<sup>1<\/sup>, los cuales tienen genoma de \u00e1cido ribonucleico (ARN), monocatenario, positivo, con una nucleoc\u00e1pside de simetr\u00eda helicoidal, con envoltura cuyos viriones pueden medir entre 50 y 200 nm de di\u00e1metro<sup>2<\/sup>, poseen una cubierta de corona de puntas a la cual deben su nombre; estos virus de ARN se constituyen en el grupo de par\u00e1sitos intracelulares m\u00e1s abundante en la biosfera.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">El coronavirus SARS-CoV-2 pertenece al orden <em>Nidovirales<\/em>, familia<em> Coronaviridae<\/em>, sub familia <em>Coronavirinae<\/em> y g\u00e9nero<em> Betacoronavirus<\/em>, es un virus zoon\u00f3tico recientemente descrito<sup>1-3<\/sup>, ha mutado y adaptado su eficiencia biol\u00f3gica lo que le facilit\u00f3 la patogenicidad humana en las proporciones que actualmente estamos viviendo<sup>4<\/sup>; este virus fue reconocido en la provincia de Hubei, ciudad de \u00a0Wuhan, China, asociado a la venta de mariscos y animales en un gran mercado; este virus fue denominado por la Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud (OMS) como 2019-nCoV (2019 novel coronavirus infection)<sup>5<\/sup> y renombrado por el Comit\u00e9 Internacional de Taxonom\u00eda de Virus como SARS-CoV-2<sup>3<\/sup>; causal de la enfermedad del tracto respiratorio agudo severo, referenciada como COVID-19 (Coronavirus Disease-2019) y declarada como &#8216;Emergencia de salud p\u00fablica de preocupaci\u00f3n internacional&#8217; el 30 de enero de 2020 por la OMS<sup>5<\/sup>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Metodolog\u00eda, resultados y conclusiones.<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">La nueva secuencia SARS-CoV-2 se compar\u00f3 con los genomas existentes en la base de datos GISAID (https:\/\/www.gisaid.org\/), utilizando el programa inform\u00e1tico de alineamiento de secuencias de ADN, ARN y prote\u00ednas: NCBI\/BLAST (https:\/\/blast.ncbi.nlm.nih.gov\/Blast.cgi) y manualmente en una hoja de c\u00e1lculo; subsecuentemente los resultados se compararon con publicaciones consultadas en los buscadores: Google Acad\u00e9mico, PubMed, http:\/\/www.epistemonikos.org\/ y\u00a0 https:\/\/www.tripdatabase.com\/index.html.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Determin\u00e1ndose que el SARS-CoV-2 gen\u00f3micamente tiene una complejidad de nucle\u00f3tidos (nts) por longitud entre 29,6 y 30,3 kilobases, de conformidad a los genomas de referencia en la base de datos GISAID: 15066 genomas, entre 29601 nts (EPI_ISL.429644) y 30355 nts (EPI_ISL.418209).<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">En segundo lugar se organiz\u00f3 la secuencia nucleot\u00eddica del SARS-CoV-2 registro EPI_ISL_402125 (MN908947, c\u00f3digo GenBank), constituido por 29903 nts (Figura 1), en esta organizaci\u00f3n se cambio Timina (T) por Uracilo (U) de conformidad a la naturaleza del virus ARN; del total de nts 8.954 son Adenina (29,9%), Uracilo 9594 (32,1%), Citocina 5492 (18,4%) y Guanina 5863 (19,6%), distribuidos de la siguiente manera: dos extremos no codificadores UTR (Untranslated Trailer): el 5\u00b4 con 265 nts (del 1 al 265) y el 3\u00b4 con 229 nts, (del 29675 al 29903); en este genoma identificaron 29 genes codificadores de 4 prote\u00ednas estructurales (E, S, M y N), 16 no estructurales (NSP-1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15 y 16) y 9 accesorias (ORF-3a,6,7b,9b,3b,7a,8,9c y 10) para un total de 29 prote\u00ednas (Anexo), el gen m\u00e1s grande es el\u00a0 OFR-1ab (Anexo y Figura1), \u00a0con 21.289 nt, (del 266 al 21555)<sup>8-9-10-11<\/sup>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">El an\u00e1lisis secuencial de los genomas del nos permiti\u00f3 determinar que el SARS-CoV-2 registra m\u00faltiples derivas g\u00e9nicas del orden de 15000, que se traducen en modificaciones de varios nts (Figura 2), donde las variaciones m\u00e1s frecuentes se ubican en los nts 6943, 8757, 27429 y 28229 correspondientes a Citocinas (C); Uracilos (U) en posiciones 11739, 28120, y Guaninas (G) 20646, 20665; adem\u00e1s llama la atenci\u00f3n la constancia de la C en posici\u00f3n 13469 en los genomas de 29903 nts. Estas mutaciones podr\u00edan estar generando un cambio en la eficiencia biol\u00f3gica del virus, de ah\u00ed su variabilidad en el per\u00edodo de incubaci\u00f3n, los s\u00edntomas y su letalidad de conformidad a la circulaci\u00f3n del virus y su comportamiento en los grupos poblacionales en los pa\u00edses donde se ha reportado<sup>12-13-14-15<\/sup>; variaciones g\u00e9nicas que podr\u00edan interpretarse como estrategias del virus de adaptaci\u00f3n al ecosistema<sup>16<\/sup>. Las modificaciones del genoma del SARS-CoV-2 podr\u00edan estar gener\u00e1ndose por errores durante la replicaci\u00f3n del virus, lo cual explicar\u00eda en buena parte la diversidad gen\u00f3mica del SARS-CoV-2 reportada<sup>17,18<\/sup>; sin embargo, las prote\u00ednas que codifican los genes no cambian. Lo que puede estar sucediendo es que el virus este desarrollando mejor eficiencia biol\u00f3gica a trav\u00e9s del cambio de nucle\u00f3tidos que se han denominado como ventajas evolutivas<sup>17<\/sup>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Otro hallazgo encontrado en el genoma fue la constancia de la C 13469 ubicada en el gen NSP12 (Non-Structural Protein), en la secuencia UUUUUAAACCGGG (Anexo). En otros genomas de tama\u00f1os diferentes al de 29903 nts la constancia de la C se determin\u00f3 en el nt 13443 y 13445. Este gen se podr\u00eda constituir en un objetivo de estudios inmunol\u00f3gicos para generar anticuerpos neutralizantes; por cuanto, este gen es indispensable para ensamblar los nts UCAGCUGAUGCACAAUCGUUUUUAAAC en la c\u00e9lula hu\u00e9sped y dar inicio a la traducci\u00f3n de nuevos genomas de virus<sup>8-9-10<\/sup>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Los genomas aislados en Colombia procedente de Bogot\u00e1 EPI_ISL_418262 y Antioquia EPI_ISL_417924 registran 29782\/29836 nt y 29782\/29782 respectivamente, durante la alineaci\u00f3n de los nts se eliminaron 2 nt \u201cN\u201d del genoma de Antioquia y 858 nt \u201cN\u201d de Bogot\u00e1, organiz\u00e1ndose un genoma definitivo de 29780 nt para Antioquia y 28924 nt para Bogot\u00e1. Se determin\u00f3 al an\u00e1lisis una concordancia del 99,9% con los genomas descritos por Fan Wu et al., Nature; National Center for Biotechnology Information<sup>7<\/sup>, en los genes estructurales N, S y no estructurales ORF1ab; el extremo no codificador UTR 3\u00b4 de los genomas de Bogot\u00e1 y Antioquia no registran la secuencia CCAUGUGAUUUUAAUAGCUUCUUAGGAGAAUGAC y el fragmento terminal de adeninas, por lo que esta regi\u00f3n se excluy\u00f3 del siguiente an\u00e1lisis.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Se ha demostrado que estos cambios nucleot\u00eddicos son el producto de la deriva g\u00e9nica y en su gran mayor\u00eda son indiferentes, pues las prote\u00ednas que codifican los genes no var\u00edan; sin embargo, la eficacia biol\u00f3gica si se ve afectada, como es el caso de algunos virus que adquieren resistencia a ciertos medicamentos<sup>19<\/sup>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Dentro de la variabilidad del genoma del SARS-CoV-2 han identificado una deleci\u00f3n completa del gen ORF8<sup>20<\/sup> (Anexo), encargado de codificar una prote\u00edna cuyo papel no se ha determinado, pero que es propia del SARS-CoV-2 entre los coronavirus<sup>8<\/sup>; este hallazgo habla de 382 nt, aunque la conformaci\u00f3n del gen ORF8 (Versi\u00f3n MN908947.3) que analizamos tiene 366 nt, de los cuales 100 son adenina, 134 uracilo, 67 guanina y 65 citocina; esto podr\u00eda tratarse de una poblaci\u00f3n viral fitness<sup>21<\/sup> aunque en la poblaci\u00f3n donde se detect\u00f3 esta deleci\u00f3n no tienen descritas una particularidades sintom\u00e1ticas que permitan establecer un cambio en la eficiencia biol\u00f3gica del virus<sup>20<\/sup>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">El an\u00e1lisis con otros genomas hom\u00f3logos de SARS-CoV-2: Pangolin (<em>Manis javanica)<\/em><em>:<\/em> <em>EPI_ISL_412860, <\/em>EPI_ISL_410721, EPI_ISL_410544, <em>y murci\u00e9lagos <\/em><em>(Rhinolophus affinis <\/em><em>y <\/em><em>Rhinolophus malayanus)<\/em><em>:\u00a0 EPI_ISL_402131, EPI_ISL_412976 y EPI_ISL_412976, se detect\u00f3 \u00a0durante la alineaci\u00f3n de los nts un promedio del 6 al 20% de nt \u201cN\u201d que dificultad su comparaci\u00f3n; sin embargo, nos encontramos que el genoma del murci\u00e9lago EPI_ISL_402131 (hCoV-19\/bat\/Yunnan\/RaTG13) tiene similitud \u00a0con el del <\/em>SARS-CoV-2 (EPI_ISL_402125) <em>del 96,9% con el total del genoma<\/em>, 96% gen N, 97% gen S y 91,9 % con el gen ORF1ab; en tanto que los genomas de los pangolines (<em>EPI_ISL_412860, <\/em>EPI_ISL_410721, EPI_ISL_410544) tuvo similitud promedio del 87% con el genoma completo, 91,2% gen N, 86,2% gen S y 90,3 con el gen ORF1ab. Otro hallazgo m\u00e1s fue que el genoma del Pangolin consta de seis ORF comunes a los SARS-CoV-2 y otros cuatro genes accesorios en comparaci\u00f3n con los seis descritos por Fan Wu et al<sup>7<\/sup> (Figura 1 y Anexo) del genoma del SARS-CoV-2.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Si bien en cierto que estos hallazgos le dan mayor peso a la descendencia del SARS-CoV-2 de los murci\u00e9lagos no descarta la posibilidad de su descendencia de los pangolines como lo refiri\u00f3 en su estudio Lu et al.<sup>22<\/sup>; de igual manera reportaron en el estudio citado similitudes aproximadas de 79% y 50% del SARS-CoV y MERS-CoV con SARS-CoV-2. Por lo tanto, SARS-CoV-2 se debe considerar el s\u00e9ptimo nuevo Betacoronavirus humano de no encontrarse hallazgos filog\u00e9nicos que digan lo contrario.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">En otro contexto y retomando uno de los aportes citados la variaci\u00f3n gen\u00f3mica del virus descrita en Singapur puede tratarse de una cuasiespecie del virus como evento de la selecci\u00f3n natural<sup>23<\/sup>, que terminar\u00eda generando un reto para las posibles vacunas que se generen dado que esta deriva g\u00e9nica implica una falla de los anticuerpos neutralizantes desarrollados, lo anterior de conformidad a las investigaciones realizadas sobre el impacto de las cuestionadas quasiespecie virales<sup>23 <\/sup>versus la terapia antiviral e inmunoterapia; sin embargo, el virus circulante en singapur como se refiri\u00f3 la enfermedad en los pacientes donde se aisl\u00f3 el virus no registr\u00f3 particularidades que permitan concluir que se trata de una quasiespecie del SARS-CoV-2.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">El hallazgo de la deleci\u00f3n del gen ORF8<sup>20 <\/sup>y lo descrito en materia de la deriva g\u00e9nica del SARS-CoV-2 podr\u00eda tratarse de un error durante la multiplicaci\u00f3n viral o en su defecto de un mecanismo evasor del virus; pero indistintamente, podr\u00eda condicionar las estrategias de vacunaci\u00f3n y terapia antiviral<sup>24<\/sup>. De lo cual se desprende que las vacunas atenuadas presentan una probabilidad de reversi\u00f3n a formas pat\u00f3genas<sup>24-25<\/sup>, pues var\u00edan en funci\u00f3n del sistema viral y del n\u00famero de derivas g\u00e9nicas implicadas en la atenuaci\u00f3n. En \u00faltimos la heterogeneidad del SARS-CoV-2 y su continua variaci\u00f3n g\u00e9nica pone en riesgo a mediano plazo las investigaciones de las actuales vacunas y las terapias antivirales<sup>24<\/sup>; por lo tanto, las vacunas deben ser multivalentes y las terapias antivirales combinadas.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Conflicto de inter\u00e9s.<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Manifiesto bajo la gravedad del juramento no estar incurso en ning\u00fan conflicto de inter\u00e9s en la publicaci\u00f3n de este documento.<\/p>\n<h2 style=\"text-align: justify;\"><a href=\"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/imagenes\/publicaciones\/2020\/Rx-SARS.pdf\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\"><strong>Ver anexo<\/strong><\/a><\/h2>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong>Referencias bibliogr\u00e1ficas:<\/strong><\/p>\n<ol>\n<li style=\"text-align: justify;\">Zhu, N., et al. (2020, Feb 20): A novel coronavirus from patients with pneumonia in China, 2019. <em>N Engl J Med.<\/em>; 382(8): 727-733; PMID: 31978945 PMCID: PMC7092803 Free PMC Article.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. (2010, Agot 24). \u00abCoronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis\u00bb. <em>Viruses<\/em> 2 (8): 1804-1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738. PMID 21994708. doi:10.3390\/v2081803<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">ICTV: Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses: The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. <em>Nat Microbiol<\/em>. 5:536-44, 2020<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">ICTV: International Committee on Taxonomy of Viruses: Naming the 2019 Coronavirus. ICTV website. Accessed April 19, 2020. https:\/\/talk.ictvonline.org\/.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">WHO: Alocuci\u00f3n de apertura del Director General de la OMS en la reuni\u00f3n ministerial de la regi\u00f3n del Mediterr\u00e1neo Oriental sobre la COVID-19 celebrada el 22 de abril de 2020. Acessed April 25, (2020). https:\/\/www.who.int\/es\/dg\/speeches\/detail\/who-director-general-s-opening-remarks-t-the-ministerial-meeting-of-the-eastern-mediterranean-region-on-covid-19-22-april-2020<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">WHO: Coronavirus Disease 2019 (COVID-19): Situation Report-51. (Published March 11, 2020). Accessed April 16, 2020. https:\/\/www.who.int\/docs\/default-source\/coronaviruse\/situation-reports\/20200311-sitrep-51-covid-19.pdf<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Wu, F., Zhao, X., Niu, P., Yang, B., Wu, H., et al. (2020, mar). A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. <em>Nature<\/em>; 579 (7798): 265-269. doi: 10.1038\/s41586-020-2008-3. PMID: 32015508. Free PMC Article.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Lu, R., Zhao, X., Li, J., Niu, P., Yang, B., Wu, H., et al. (enero, 2020) Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. <em>The Lancet Lond Engl<\/em>; 64.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Wu C, Liu Y, Yang Y, Zhang P, Zhong W, Wang Y, et al. (febrero, 2020) Analysis of therapeutic targets for SARSCoV-2 and discovery of potential drugs by computational methods. Acta Pharm Sin B [Internet]; Disponible en: http:\/\/www.sciencedirect.com\/science\/article\/pii\/S2211383520302999<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Boheemen S., de Graaf M., Lauber C., Bestebroer T.M., Raj V.S., Zaki A.M. (2012). Genomic characterization of a newly discovered coronavirus associated with acute respiratory distress syndrome in humans.\u00a0<em>mBio.<\/em>; 3(6)\u00a0e00473\u201312.\u00a0[Google Scholar]<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Yang D., Leibowitz J.L. (2015). The structure and functions of coronavirus genomic 3\u2032 and 5\u2032 ends.\u00a0<em>Virus Res<\/em>.\u00a02015; 206:120\u2013133.\u00a0[PMC free article]\u00a0[PubMed]\u00a0[Google Scholar]<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Lu R., Zhao X., Li J., Niu P., Yang B., Wu H. (2020). Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding.\u00a0<em>The <\/em><em>Lancet<\/em>; 395(10224):565\u2013574.[PMC free article]\u00a0[PubMed]\u00a0[Google Scholar]<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">CDC. Centers for Disease and Control and Prevention. (2020).\u00a0 (EE. UU.), ed. (31 de enero de 2020). \u00abSymptoms of Novel Coronavirus (2019-nCoV)\u00bb. Consultado el 1 de mayo de 2020.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Velavan, Thirumalaisamy P.; Meyer, Christian G. (febrero de 2020). \u00abThe COVID-19 epidemic\u00bb. <em>Tropical Medicine &amp; International Health<\/em>; 25 (3): 278-280. ISSN 1365-3156. PMID 32052514. doi:10.1111\/tmi.13383.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Anderson, Roy M.; Heesterbeek, Hans; Klinkenberg, Don; Hollingsworth, T. D\u00e9irdre (marzo de 2020). \u00abHow will country-based mitigation measures influence the course of the COVID-19 epidemic?\u00bb. <em>The Lancet<\/em>; 395 (10228): 931-934. PMID 32164834. doi:10.1016\/S0140-6736(20)30567-5. Consultado el 1 de mayo de 2020.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">De Filippis VR, Villareal LP. (1.999). <em>Virus evolution<\/em>. En: Virology. Vol.1. New York:Lippincott-Raven; p.353-70.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Pan, X. P., Li, L. J., Du, W. B., Li, M. W., Cao, H. C., Sheng, J. F. (2007, noviembre). \u00abDifferences of YMDD mutational patterns, precore\/core promoter mutations, serum HBV DNA levels in lamivudine-resistant hepatitis B genotypes B and C\u00bb. <em>J. Viral Hepat<\/em>. 14 (11): 767-74. PMID 17927612. doi:10.1111\/j.1365-2893.2007.00869.x. Consultado el 1 de mayo de 2020.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Sheikh A, Al\u2010Taher A, Al\u2010Nazawi M, Al\u2010Mubarak AI, Kandeel M. (2020). Analysis of preferred codon usage in the coronavirus N genes and their implications for genome evolution and vaccine design. <em>J Virol Methods<\/em>; 277: 113806. Crossref CAS PubMed Web of Science\u00ae Google Scholar<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Makhija A, Kumar S. (2015) Analysis of synonymous codon usage in spike protein gene of infectious bronchitis virus. <em>Can J Microbiol<\/em>; 61(12): 983\u2010 989. Crossref CAS PubMed Web of Science\u00ae Google Scholar<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Hampson, A. W., Mackenzie, J. S. (noviembre de 2006). \u00abThe influenza viruses\u00bb. <em>Med. J. Aust<\/em>. 185 (10 Suppl): S39-43. PMID 17115950. Consultado el 1 de mayo de 2020.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Discovery of a 382-nt deletion during the early evolution of SARS-CoV-2. (Marzo, 2020) bioRxiv [Internet]: Disponible en el enlace https:\/\/www.biorxiv.org\/content\/10.1101\/2020.03.11.987222v. Consultado el 30 de abril de 2020.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Novella I, Santiago EF, Moya A, Domingo E, Holland JJ. (1995). Size of genetic bottlenecks leadind to virus fitness loss is determined by mean initial population fitness<em>. <\/em><em>J. Virol<\/em>; 69:2869-72.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">R. Lu, X. Zhao, J. Li, et al. (2020). Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. <em>Lancet.<\/em>, S0140-6736 (20), pp. 30251-30258, 10.1016\/S0140-6736(20)30251-Google Scholar<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Metzner, K. J. (diciembre de 2006). \u00abDetection and significance of minority quasispecies of drug-resistant HIV-1\u00bb. <em>J HIV Ther<\/em> 11 (4): 74-81. PMID 17578210. Consultado el 1 de mayo de 2020.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Knopf CW. (1998). Evolution of viral DNA-dependent DNA polymerases. <em>Virus genes<\/em>; 16:47-58.<\/li>\n<li style=\"text-align: justify;\">Novella I, Santiago EF, Moya A, Domingo E, Holland JJ. (1995). Size of genetic bottlenecks leadind to virus fitness loss is determined by mean initial population fitness. <em>J Virol<\/em>; 69:2869-72.<\/li>\n<\/ol>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2 Autor principal: Luis Eduardo Manotas S. Vol. XV; n\u00ba 11; 469<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[79],"tags":[12825,13971,6095,608,13173,13172,12760,13170,13171],"class_list":["post-56267","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-enfermedades-infecciosas","tag-coronavirus","tag-covid19","tag-evolucion","tag-genoma","tag-implicaciones-biologicas","tag-intercambio-de-genes","tag-mutaciones","tag-sars-cov-2","tag-variantes-fenotipicas","no-featured-image-padding"],"acf":[],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v28.2 - https:\/\/yoast.com\/product\/yoast-seo-wordpress\/ -->\n<title>Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2 Autor principal: Luis Eduardo Manotas S. Vol. XV; n\u00ba 11; 469 Radiology of the genomic\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Escrito por\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Redacci\u00f3n Revista\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Tiempo de lectura\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"15 minutos\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\\\/\\\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"ScholarlyArticle\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/#article\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/\"},\"author\":{\"name\":\"Redacci\u00f3n Revista\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#\\\/schema\\\/person\\\/aff35293bfdd1e8bb11bc1d216ac2c6e\"},\"headline\":\"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2\",\"datePublished\":\"2020-06-12T08:04:25+00:00\",\"dateModified\":\"2020-12-02T11:01:37+00:00\",\"mainEntityOfPage\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/\"},\"wordCount\":2956,\"commentCount\":0,\"publisher\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#organization\"},\"keywords\":[\"coronavirus\",\"COVID\u201119\",\"evoluci\u00f3n\",\"genoma\",\"implicaciones biol\u00f3gicas\",\"intercambio de genes\",\"mutaciones\",\"SARS-CoV-2\",\"variantes fenot\u00edpicas\"],\"articleSection\":[\"Enfermedades infecciosas\"],\"inLanguage\":\"es\"},{\"@type\":[\"WebPage\",\"ItemPage\"],\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/\",\"name\":\"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#website\"},\"datePublished\":\"2020-06-12T08:04:25+00:00\",\"dateModified\":\"2020-12-02T11:01:37+00:00\",\"description\":\"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2 Autor principal: Luis Eduardo Manotas S. Vol. XV; n\u00ba 11; 469 Radiology of the genomic\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"es\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\\\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Inicio\",\"item\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Enfermedades infecciosas\",\"item\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/publicaciones\\\/enfermedades-infecciosas\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":3,\"name\":\"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#website\",\"url\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/\",\"name\":\"Revista Electr\u00f3nica de PortalesMedicos.com\",\"description\":\"ISSN 1886-8924 - Publicaci\u00f3n de art\u00edculos, casos cl\u00ednicos, etc. de Medicina, Enfermer\u00eda y Ciencias de la Salud\",\"publisher\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#organization\"},\"alternateName\":\"Revista de PortalesMedicos\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"es\"},{\"@type\":\"Organization\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#organization\",\"name\":\"Revista Electr\u00f3nica de Portales Medicos.com\",\"alternateName\":\"Revista de PortalesMedicos\",\"url\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/\",\"logo\":{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"es\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#\\\/schema\\\/logo\\\/image\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/wp-content\\\/uploads\\\/logorevista_negro.jpg\",\"contentUrl\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/wp-content\\\/uploads\\\/logorevista_negro.jpg\",\"width\":199,\"height\":65,\"caption\":\"Revista Electr\u00f3nica de Portales Medicos.com\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#\\\/schema\\\/logo\\\/image\\\/\"}},{\"@type\":\"Person\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/#\\\/schema\\\/person\\\/aff35293bfdd1e8bb11bc1d216ac2c6e\",\"name\":\"Redacci\u00f3n Revista\",\"sameAs\":[\"https:\\\/\\\/x.com\\\/portalesmedicos\"],\"url\":\"https:\\\/\\\/www.revista-portalesmedicos.com\\\/revista-medica\\\/author\\\/pmedadmin\\\/\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2","description":"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2 Autor principal: Luis Eduardo Manotas S. Vol. XV; n\u00ba 11; 469 Radiology of the genomic","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/","twitter_misc":{"Escrito por":"Redacci\u00f3n Revista","Tiempo de lectura":"15 minutos"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"ScholarlyArticle","@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/#article","isPartOf":{"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/"},"author":{"name":"Redacci\u00f3n Revista","@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#\/schema\/person\/aff35293bfdd1e8bb11bc1d216ac2c6e"},"headline":"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2","datePublished":"2020-06-12T08:04:25+00:00","dateModified":"2020-12-02T11:01:37+00:00","mainEntityOfPage":{"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/"},"wordCount":2956,"commentCount":0,"publisher":{"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#organization"},"keywords":["coronavirus","COVID\u201119","evoluci\u00f3n","genoma","implicaciones biol\u00f3gicas","intercambio de genes","mutaciones","SARS-CoV-2","variantes fenot\u00edpicas"],"articleSection":["Enfermedades infecciosas"],"inLanguage":"es"},{"@type":["WebPage","ItemPage"],"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/","url":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/","name":"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2","isPartOf":{"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#website"},"datePublished":"2020-06-12T08:04:25+00:00","dateModified":"2020-12-02T11:01:37+00:00","description":"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2 Autor principal: Luis Eduardo Manotas S. Vol. XV; n\u00ba 11; 469 Radiology of the genomic","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/#breadcrumb"},"inLanguage":"es","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/radiologia-de-la-estructura-genomica-del-coronavirus-sars-cov-2\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Inicio","item":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Enfermedades infecciosas","item":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/publicaciones\/enfermedades-infecciosas\/"},{"@type":"ListItem","position":3,"name":"Radiolog\u00eda de la estructura gen\u00f3mica del coronavirus SARS-CoV-2"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#website","url":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/","name":"Revista Electr\u00f3nica de PortalesMedicos.com","description":"ISSN 1886-8924 - Publicaci\u00f3n de art\u00edculos, casos cl\u00ednicos, etc. de Medicina, Enfermer\u00eda y Ciencias de la Salud","publisher":{"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#organization"},"alternateName":"Revista de PortalesMedicos","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"es"},{"@type":"Organization","@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#organization","name":"Revista Electr\u00f3nica de Portales Medicos.com","alternateName":"Revista de PortalesMedicos","url":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/","logo":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"es","@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#\/schema\/logo\/image\/","url":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-content\/uploads\/logorevista_negro.jpg","contentUrl":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-content\/uploads\/logorevista_negro.jpg","width":199,"height":65,"caption":"Revista Electr\u00f3nica de Portales Medicos.com"},"image":{"@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#\/schema\/logo\/image\/"}},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/#\/schema\/person\/aff35293bfdd1e8bb11bc1d216ac2c6e","name":"Redacci\u00f3n Revista","sameAs":["https:\/\/x.com\/portalesmedicos"],"url":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/author\/pmedadmin\/"}]}},"views":2173,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/56267","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=56267"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/56267\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=56267"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=56267"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.revista-portalesmedicos.com\/revista-medica\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=56267"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}